L'école primaire St. Mary's de Maligaon a été créée en tant qu'école secondaire pour soulager la pression des admissions à l'école St. Mary's de Guwahati. L'école primaire a été ouverte le 10 janvier 1966. Les sœurs et les enseignants venaient quotidiennement de St. Mary's Guwahati pour donner des cours dans un bâtiment temporaire, tout en supervisant la construction d'un nouveau bâtiment scolaire. En 1969, l'école est passée en classe IV avec 240 garçons, 145 filles, 8 enseignants et 9 autres employés.
Remise à niveau de l'école
En raison de la pression constante des parents de nos élèves qui avaient du mal à être admis au lycée de St. Mary's, Guwahati, la direction a décidé de moderniser l'école. Ainsi, à partir de janvier 1988, la classe VIII a été introduite et la modernisation s'est poursuivie. En janvier 1991, l'école devient une école secondaire à part entière. Le premier groupe d'élèves s'est présenté aux examens publics du HSLC en mars 1992. Le lycée anglais St. Mary's de Maligaon a obtenu sa reconnaissance du Board of Secondary Education, Assam (SEBA) avec effet au 1er avril 1998.
Affiliation au Conseil central de l'enseignement secondaire, Delhi (CBSE)
Conformément à la demande continue des parents, nous avons décidé d'affilier l'école au Conseil central et la question a été portée devant les autorités supérieures. Après l'autorisation nécessaire de leur part, le processus d'affiliation de l'école au Conseil central de l'enseignement secondaire a commencé. Enfin, en avril 2011, l'école a été affiliée à C.B.S.E. Voir le numéro d'affiliation 230105 et le code scolaire : 30086. Nous nous réjouissons du premier groupe d'élèves de la classe X qui passent leur examen sous C.B.S.E. et les excellents résultats apportés par eux. Cela nous a donné l'impulsion nécessaire pour faire passer l'école au niveau secondaire supérieur. L'autorisation nécessaire a été accordée en avril 2013. À l'heure actuelle, il y a 127 étudiants en classe XI, dans les trois filières d'études, à savoir les sciences, le commerce et les sciences humaines.